科学网新冠病毒可能发生国际进一步扩散，长期
文章出处：大发888娱乐游戏 人气：发表时间：2020-02-08 10:08
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英国研究预估了未来三个月内新冠病毒的全球传播风险
为了评估2020年1月至2020年4月武汉新型冠状病毒（2019-nCoV）在中国国内外传播的潜在风险和地理范围。
综合生物信息学分析为2019-nCoV的分子机制提供了深入了解 据报道，2019-nCoV与SARS-CoV有同一个入口：ACE2。分析冠状病毒的分布和表达水平可能有助于揭示病毒易感性和感染后调节的潜在机制。
成都呼吸健康研究所研究人员，发现ACE2在健康人群和有基础疾病的患者中表达无明显差异，表明他们的易感性相对相似，这与目前的临床观察一致。
此外，基于吸烟个体中ACE2的表达情况，研究人员推断长期吸烟可能是易感2019-nCoV的危险因素。
另一方面，对SARS-CoV感染细胞中ACE2的分析表明，ACE2不仅仅是一个受体，还参与了感染后的调节，包括免疫反应、细胞因子分泌和病毒基因组复制。
研究人员还构建了蛋白—蛋白相互作用网络，并鉴定了病毒活性和细胞因子分泌的枢纽基因。该发现可以解释到目前为止的2019-nCoV肺炎的临床症状，并帮助临床医生和研究人员了解发病机制和设计治疗策略。
作者：Xiang He、Lei Zhang、Qin Ran、Anying Xiong、Junyi Wang、Dehong Wu、Feng Chen、Guoping Li相关论文信息：https://doi.org/10.1101/2020.02.03.20020206
2019年新冠病毒的人际传播
2019年12月31日，中国武汉报道了人群中的2019年新冠病毒（2019-nCoV）暴发。 广东省疾控中心的研究人员分析了实地调查和基因测序的数据，从而提供了人与人之间传播的证据。 确诊为2019-nCoV阳性的病例由咽拭子、鼻拭子、支气管肺泡灌洗液（BALF）或气管内抽吸物的实时逆转录聚合酶聚合酶链反应分析（RT-PCR）或基因测序结果所定义。每例确诊病例都进行了实地调查。确诊病例的临床和人口统计学数据是从他们的病历中收集的。通过访谈确诊病例获得了暴露和旅行史。 研究人员发现，2020年1月1日至21日，中国广东省确认了17例确诊病例。其中，有2例（11.8％）在当地发病，发病前14天内没有去武汉旅行或有野生动植物接触史。这两个病例来自两个家庭性感染，分别包括4例和2例指示病例。这两个病例的病毒全基因组与它们的参考病例完全相同，并呈现出一些独特的单核苷酸变体（SNV），这可能分别导致刺突蛋白和Orf8蛋白发生一个氨基酸变化。 总之，这项研究确定了中国广东省的两例2019-nCoV人际传播病例，这表明减少家庭、医院和社区中2019-nCoV人际传播的预防策略需要立即实施。 作者：Min Kang, Jie Wu, Wenjun Ma, JianfengHe, Jing Lu, Tao Liu, Baisheng Li, Shujiang Mei, Feng Ruan, Lifeng Lin, LirongZou, Changwen Ke, Haojie Zhong, Yingtao Zhang, Xuguang Chen, Zhe Liu, Qi Zhu,Jianpeng Xiao, Jianxiang Yu, Jianxiong Hu, Weilin Zeng, Xing Li, Yuhuang Liao,Xiujuan Tang, Songjian Xiao, Ying Wang, Yingchao Song, Xue Zhuang, Lijun Liang,Siqing Zeng, Guanhao He, Peng Lin, Tie Song相关论文信息：Human-to-human transmission of2019-novel coronavirus (2019-nCoV)DOI: 10.1101/2020.02.03.20019141
基于网络寻找能够再利用的药物治疗人类冠状病毒
人类冠状病毒（HCoV），包括严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）和2019年新型冠状病毒（2019-nCoV），以高发病率和高死亡率引起全球流行。但是，目前没有针对2019-nCoV的有效药物。与从头进行药物发现相比，重新利用现有药物是一种有效的药物发现策略，它可以缩短时间并降低成本。 美国克利夫兰诊所的研究人员提出了一种整合的抗病毒药物再利用方法，其执行了一个基于系统药理学的网络药物平台，从而量化了HCoV-宿主相互作用组与人类蛋白质-蛋白质相互作用网络中药物靶标之间的相互作用。 对15个HCoV全基因组的系统进化分析显示，在其他六种已知的致病性HCoV中，2019-nCoV与SARS-CoV的核苷酸序列同一性最高（79.7％）。具体而言，2019-nCoV的包膜蛋白和核衣壳蛋白是两个进化保守区域，与SARS-CoV相比，其序列同一性分别为96％和89.6％。使用药物靶标的网络邻近分析和人类蛋白质-蛋白质相互作用组中已知的HCoV-宿主相互作用，研究人员计算确定了135种潜在可重用的药物，可被用于预防和治疗HCoV。此外，研究人员对16种潜在的抗HCoV可重复利用药物（包括褪黑素、巯基嘌呤和西罗莫司）进行了优先排序，并通过药物-基因特征和HCoV在人类细胞系中引起的转录组学数据的富集分析来进一步验证。最后，研究人员展示了通过Complementary Exposure模式获得了三种潜在药物组合（包括西罗莫司+放线菌素、巯基嘌呤+褪黑素、以及托瑞米芬+大黄素）：这些药物的靶标均在HCoV-宿主子网络中，但在人类蛋白质-蛋白质互作网络中却分别靶向了不同的对象。 总而言之，这项研究提供了基于网络的强大方法，可以快速识别候选可重复使用的药物和潜在的药物组合，以用于以后的HCoV临床试验。 作者：Yadi Zhou, Yuan Hou, Jiayu Shen, YinHuang, William Martin, Feixiong Cheng相关论文信息：Network-based Drug Repurposing forHuman CoronavirusDOI: 10.1101/2020.02.03.20020263 使用简单模型预测武汉冠状病毒（2019-nCoV）的流行
使用截至2020年1月28日（可靠确诊病例的前13天）的数据，美国加州大学伯克利分校的研究人员分析了中国大陆确诊的感染病例。此外，截至2月3日的所有可用数据都以相同的方式处理。 对于第一个期间，累积的案例数遵循指数函数。但是，从1月28日起，研究人员发现与指数增长呈下降趋势。有效繁殖数量的持续下降也证实了这种慢于指数的增长。反向趋势分析表明原始的基本再现数R0约为2.4到2.5。 研究人员使用了一个简单的逻辑增长模型，直到撰写该论文为止，该模型非常适合所有报告的数据。使用此模型和第一组数据，研究人员估计2月中旬达到此水平的最大病例约为21000。使用所有可用数据，最大病例数会更高，为29000，但其动态不会改变。这些预测没有考虑到任何其他可能的次要感染源。 作者：Slav W Hermanowicz相关论文信息：Forecasting the Wuhan coronavirus(2019-nCoV) epidemics using a simple (simplistic) modelDOI: 10.1101/2020.02.04.20020461 人口流动和城市封锁对新冠病毒传播的影响 在中国武汉市，由新型冠状病毒（2019-nCoV）引起的肺炎暴发引起了全球关注，武汉的人口外流促进了病毒在中国其他地区的空间扩张。 中山大学等机构的研究人员分析了武汉人口外流对中国其他省市2019-nCoV传播的影响以及武汉城市关闭的影响。研究人员观察到人口流动与病例数之间存在显着正相关。进一步的分析表明，如果提前两天实施城市关闭政策，则可以预防1420起（95％置信区间：1059，1833）感染；如果晚两天，则可能增加1462起（95％置信区间：1090，1886）感染。 这项研究结果表明，人口流动可能是中国2019-nCoV感染传播的重要诱因，而城市关闭的政策可以有效预防这种流行病。 作者：Siqi Ai, Guanghu Zhu, Fei Tian, Huan Li,Yuan Gao, Yinglin Wu, Qiyong Liu, Hualiang Lin相关论文信息：Population movement, city closureand spatial transmission of the 2019-nCoV infection in ChinaDOI: 10.1101/2020.02.04.20020339 疫苗或快速检测或将疫情数字迅速推向零
任何旨在制止2019-nCov疫情的计划都必须基于对需采取有效控制措施加以保护的危险人口比例的定量认识，以便使传播得到充分控制，从而使流行得以结束。
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